dos2unix - заменить символ окончания строки (перевод каретки)
Есть замечательная утилита dos2unix
. Пример замены символов перевода строк во всех файлах текущего каталога:
find . -type f -exec dos2unix {} \;
Или с указанием пути к каталогу:
find /path -type f -exec dos2unix {} +